El mas nuevo de todos los museos de la ciudad de Cuautla, es el Museo de la Independencia, ubicado en el viejo templo de San Fernando en el Centro de la Ciudad de Cuautla, y uno de los puntos de resistencia de las tropas de Morelos durante el Sitio de Cuautla durante la Guerra de Independencia.
Como lo dice su nombre, esta dedicado a la participacion de la Ciudad en la Guerra de Independencia, el largo Sitio al que fue sometida por las tropas del bestial Calleja, ademas de algunas salas dedicadas a la vida colonial.
El museo esta ubicado en el cruce de las calles de Galeana y el Fin del Rul, en donde estaba ubicada la estacion de ferrocarril.
